Die Charité ist eine der führenden Institutionen der Lebenswissenschaften. Forschung und klinische Anwendung sind eng miteinander verzahnt. Sie wirbt jährlich mehr als 100 Millionen Euro Drittmittel ein, einen Großteil davon von der Deutschen Forschungsgemeinschaft (DFG) und dem Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF). Die Charité hat bei zehn Sonderforschungsbereichen der DFG die Sprecherfunktion.

In mehr als 1.000 Forschungsprojekten, Arbeitsgruppen und Kooperationen sind rund 3.000 Wissenschaftler und Ärzte beschäftigt. Ein Drittel aller universitären Erfindungen und Patente öffentlicher Einrichtungen in Berlin stammen aus der Charité. Das Universitätsklinikum spielt eine entscheidende Rolle für die Entwicklung der Gesundheitsregion Berlin-Brandenburg.

Die Charité ist die einzige medizinische Fakultät in Deutschland, die im Rahmen der Exzellenzinitiative ein Exzellenzcluster und zwei Graduiertenschulen verantwortlich führt.